Вообще-то Book Designer и Book Writer славятся невалидностью получаемых с их помощью книг. FBE не конвертирует, но!
Я делаю так: выделяю текст в браузере и CtrlV его в FBE, но, конечно, приходится следить, чтобы не нарушить выделение текста (жирный шрифт, курсив), но оно встречается нечасто, так что вполне подходящий способ. Потом еще можно пройтись скриптом "Генеральная уборка" и все в порядке.
Ещё есть сетевая программа web2fb2, но с ее помощью иногда получаются тексты, у которых нарушены границы абзацев(т.е. абзацы почему-то начинаются и заканчиваются не там, где в исходной книге), но зато выделения жирным и курсивом такие же, как в исходной книге. Я смотрел, какой текст он (web2fb2) генерит и заметил, что в конце абзацев(параграфов) он всегда ставит возврат каретки и перевод строки(что для fb2 книги неважно), но не всегда расставляет тэги </p><p>(что как раз и определяет,где конец одного и начало другого абзаца), из-за этого абзацы слипаются.